Derivado de la necesidad de unificar esfuerzos técnicos y de gestión para el cumplimiento de los compromisos del eje de Innovación Tecnológica, se crea la MIIT como un mecanismo de coordinación interinstitucional.
La Mesa Interinstitucional de Innovación Tecnológica fue creada el 24 de Agosto del 2016 y actualmente está siendo coordinada por la Secretaría Nacional de Ciencia y Tecnología.
La Mesa Interinstitucional de Innovación Tecnológica también es denominada por sus siglas como MIIT.